>В начале XVI века, когда стены обветшали, каменные
>проездные башни разобрали до первого яруса, и на их каменной
>кладке срубили деревянные башни. Участки каменных стен также
>были полуразобраны и засыпаны землей и глиной, а поверх
>образовавшегося вала поставили деревянную стену.
>Если этому верить, то новгородцы никак поголовно впали в
>маразм.

С появлением артиллерии каменные стены могли быть разрушены, а вот земляной вал с деревянным каркасом, был для неё неуязвим.

>Что касается 6 км "сохранившихся" валов, сравните фотографии
>Алексеевской башни (взяты из Википедии). Очевидно, что вал,
>примыкающий к этой башне, насыпан в ХХ веке, причём как-то
>неправдоподобно.

Вал не подсыпали с 1610 года. Наоборот - он подвергался разрушению в 1611, 1700-1721, 1941-1944 гг.



Белая (Алексеевская) башня конец XIX в. — начало XX в.



Вид с вала