Не углубившись в мою систему элементов установить происхождение слов вообще невозможно, так и придется прыгать по словарям, в которых зафиксированы уже гораздо более поздние формы и значения.

Итак,

ЗеЛ/ен/ый ="цвет живого" (уЗ- узы, связь, эЛ - жить, быть, живое)

Ч/еР/н/ый = "цвет копоти" (Ч=Т+Ш=уТ+эш=огонь+делать = копоть, уголь) (ср. ТШ/ад, ТШ/удо, ТШ/ары, ТШ/ер/т..) т.е.,
Т+Ш+Р = огонь+дело+черта = след угля, след копоти

СиН/ий = "цвет воды" (поэтому иногда обозначает и зеленое)
С+Н= иС+оН= вода + поверхность, на. Су - вода, тат., shui (шуЭй) вода, кит.

КР/С/н/ый = "цвет крови". В свою очередь, "кровь" = результат пореза
К+Р+В = уК+эР+оВ = колоть, резать + борозда, линия + результат, плод.
То есть,
КР+С = порез + вода, жидкость (су)

Вообще, КР - это резать, убивать. КаРать, окорнать и тп. КРеСТ = КаРа + СуТь. Если лечить кровопусканием, то КРеСТос вполне становится целителем. И тд.

Всё. Другие цвета не выделялись в то время, нужды не было.