>То есть, реалии "Пугачевской" войны нужно начинать
>распутывать с завоевания Южного Урала в 1737-1744 гг.

И это в то самое время, когда уже существовал г Сургут и указом еще Бориса Годунова (самое смешное, что на основании просьбы одного из местных князьков) от 1604 основывается г Томск.
http://www.vostlit.info/Texts/Dokumenty/Russ/XVII/1600-1620/Tomsk_ist/text1.htm

Ну историю Сибири писал-то еще сам Миллер. Тут интересный нюанс: г Томск решено ставить в уже существующей Томской волости.

Понятно, что Томск основан еще до Романовых, но как это все у историков уживается с агарянской страной - тайна сия велика есть. Для меня.

А какими источниками вы пользуетесь?