...поэтому внешность индейцев для него была доказательством достижения Японии...

Это говорит о том, что и внешность индейцев и внешность японцев(монголов, китайцев) в Европе были неизвестны. То же спаведливо в отношении индейцев Нового Света и индийцев Индии, я полагаю...
Кстати, европейцы довольно быстро разобрались, что они открыли не Индию, а другой континент, но продолжали упорствовать в своем заблуждении, и попрежнему обзывать коренное население Америки индейцами.

...Колумб и не подозревал, что японцы - это монголоидная раса...

Классификация по расам случилась гораздо позже.