*А вот пример ЯРА(ягненок)/ЯРКА (овца) -> БАРАН (самец овцы) это трансформация другого рода. Тут удлинение слова для получения нового, имеющего другой смысл, хотя и родственного по сути. Появление звука Б здесь не обязано подчиняться какой-то логике и/или правилам замещения. Тут мог оказаться и С, и В (варан?), и ещё что-то.*

Мне кажется какая-то логика должна присутствовать обяательно.

На мой взгляд названия животных построены на противоположностях:
ЯР (молодо,зелено) - БР (взросло, спело-красно).

Корень ЯР может иметь варианты ЯЛ, ЯГ.

Корень БР может иметь варианты БЛ, ПР, ПЛ, ВР, ВЛ и другие. Отсюда видимо происходят слова БОЛЬШОЙ, ВЕЛИКИЙ и др.

Примеры:
ЯРКА (овца), ЯРА, ЯГненок - БаРан

ЯЛовица (телка) - БыК (второй согласный звук в корне трансформировался по схеме Р - Г - К)

ЖЕРЕБЕНОК, ЖЕРЕБЕЦ (звук Й трансформировался по схеме Й - Г -Ж) - БАХМАН (великорослый конЬ)(Второй согласный звук трансформировался по схеме Р -Г - Х)

ЯРец (молодой бобр) - БОБР

Поросенок - БоРов

Ребенок ( звук ЙА потерялся) - БРат

Другие названия животных с корнем БР и его вариациями:
БаРсук, ВоЛ, БеРкут, ВоЛк, БаРс, БиРюК, БабР (тигр),и др.