ОДИН {9}
ныне числительное, первоначально имело значение «некто» (неизвестный)
< пс ODg (м2)

ДРС: ОДИНОКИЙ, ОДНАКО, ОДИНЕЦ, ОДИНАДЦАТЬ, ЕДИНСТВО, ЕДИНИЦА, ...
ПРИМ: клерикальное ОДИН (ВОДАН) - сканд.верх.бог, возможно, АДАМ, …

Слово: один,
Ближайшая этимология: одна, одно, укр. один, одна, одно, блр. одзiн, др.-русск. одинъ, одина, ст.-слав. Љдинъ, Љдина, Љдино, но также ЉдЮнъ, ЉдЮна, ЉдЮного и т. д. (часто в Супр., Ляпунов 167 и сл.; Дильс, Aksl. Gr. 94), болг. един, една, едно, сербохорв. jе°дан, jе°дна, словен. edЌn, ena, eno, чеш., слвц. jeden, jedna, jedno, польск. jeden, jedna, jedyny "единственный", в.-луж. jedyn, jеnа, н.-луж. jaden, jаnа. Форма единый заимств. из цслав. Праслав. *edinъ, *edina; сокращение i в ь едва ли является праслав. процессом, но скорее имело место в отдельных языках; см. Ягич, AfslPh 22, 261; Брюкнер, AfslPh 29, 119; KZ 46, 204.
Дальнейшая этимология: Вероятно, сложение из *еd- и inъ; ср. едва, лат. ессе "вон, се", ecquis "кто-нибудь?", умбр. еr№еk, erse -- то же. От и.-е. основы местоименного е-; см. Бругман, Grdr. 2, 2, 326 и сл.; IF 23, 310 и сл.; Бернекер 1, 262; Миккола, Ursl. Gr. 3, 56; Вальде--Гофм. 1, 390 и сл. Менее правдоподобно сближение со ст.-слав. еда "разве, ли", др.-инд. уаdѓ "если" (Брюкнер 204). Следует, далее, отклонить сравнение с др.-инд. ѓdis• "начало", вопреки Уленбеку (Aind. Wb. 21), Ван-Вейку (IF 30, 384 и сл.); см. против этого Лиден, Тосhаr. Stud. 7; Гуйер, "Slavia", 2, 560. Вторая часть заключает в себе *inъ (см. иной), связанное чередованием с арм. энкл. -in "тот же самый", др.-лат. оinоs "іnus", греч. o‡nh "одно очко", ирл. oin, оеn "один", гот. ains "один": см. Бернекер, там же; Педерсен, Kelt. Gr. 1, 57; Мейе, Et. 159; МSL 14, 348. Отсюда же одинец "одиноко, отдельно живущий от стада старый кабан", укр. одинець -- то же, польск. оdуniес "кабан, вепрь" (Потебня, РФВ, I, 77), а не калька из греч. moniТj "живущий в одиночку (о диких зверях)".

Моё мнение. Чередование первой гласной (один-един) может быть объяснено особенностью произношения восточных славян, а в результате прижились оба варианта слова, каждое со своим смысловым оттенком.
Моё подозрение, что исходно «один» означало «некто», неожиданно нашло подтверждение у классиков реконструкции праиндоевропейского языка:
Гамкрелидзе Т. В., Иванов Вяч. Вс. Индоевропейский язык и индоевропейцы. Реконструкция и историко-типологический анализ праязыка и протокультуры. — Т. I—II. — Тбилиси: Изд-во Тбилисского ун-та, 1984
Об этом можно прочитать прямо у них, но я потом буду (надеюсь) более основательно проходиться по всем заявленным словам базовой лексики, вернусь и к этому вопросу и приведу соответствующие цитаты.