pencil – карандаш, см. «pen»

pencil (n.) (кисточка для артистов, сделанная из верблюжьей шерсти); из старофранцузского «pincel» - кисточка для артистов; из латинского «penicillus» - кисть художника, кисть, дословно – хвост; уменьшительное от «peniculus» - кисть; уменьшительное от «penis» - хвост
early 14c., "an artist's fine brush of camel hair," from Old French pincel "artist's paintbrush" (13c., Modern French pinceau), from Latin penicillus "painter's brush, hair-pencil," literally "little tail," diminutive of peniculus "brush," itself a diminutive of penis "tail" (see penis). Small brushes formerly were used for writing before modern lead or chalk pencils; meaning "graphite writing implement" apparently evolved late 16c.

penis (n.) (из французского «pénis»); из латинского «penis» - мужской половой член, ранее – хвост; из PIE *pes- мужской половой член.
1670s, perhaps from French pénis or directly from Latin penis "penis," earlier "tail," from PIE *pes- "penis" (cognates: Sanskrit pasas-, Greek peos, posthe "penis," probably also Old English fæsl "progeny, offspring," Old Norse fösull, German Fasel "young of animals, brood"). The proper plural is penes. The adjective is penial.

1675:
PENCIL (pensel, Teut., pencean, F. penicillum, L.) – маленткий инструмент, используемый в рисовании
PENCIL of Rays (в оптике) – двойной пучок света, соединенный вместе в основании.
Интересное кино получается, т.е. в основе – пучил (пук), с «en» - юсом. И никакого отношения к «пенису». ПЧЛ – P (N) CL. Тогда понятно, почему хвост. У некоторых животных это, действительно пучок.

1826:
PENCIL, s. – маленькая волосатая кисточка, инструмент для письма, без использования чернил.
Т.е. тут могут быть два источника
1) Писало, см. «pen»
2) Пук, пучок.

Дворецкий:
panicula, ae f
1) кисть, метёлка, пучок (у растений) PM;
2) род опухоли или нарыва.

Все правильно – нарывет – пучит, пучило.
Пучить`Толковый словарь Ефремовой`
несов. перех. и неперех. разг. 1) безл. Становиться вздутым; вздыматься.

«Британника» (1 изд., стр. 466) четко разделяет по видам, одни сделаны с тонкими кончиками, с толщиной палочки, другие – в виде кисти