>Слово исконный означает существующий с давних времён,
>возможно и начала не имеющий или это начало установить не
>возможно, а начальный - некая точка во времени, давшая начало
>последующему событию. Смысл слов разный.
>Значит и корни разные.
>

Исконный вообще никакого отношения ни к концу, ни к началу не имеет.
Исконный - это не из-конн-ый, а (в татарском, ударение на последний слог):

иске пр 1. старый, изношенный // изношенное 2. старый, ветхий, обветшалый 3. старый, устаревший //
устаревшее, старое 4. старый, давно существующий 5. застарелый 6. старинный, древний, давний
7. былой, давно минувший, прошлый (времена) 8. старый, прежний (адрес)
искедән нар издавна, исстари
искелек сущ 1. старое, прошлое 2. косность, рутина
иске-москы сущ старьё, рвань, тряпьё, утиль // изношенный, старый
иске-москычы сущ старьёвщик
искергән пр 1. устаревший, устарелый 2. изношенный, ветхий 3. чёрствый
искерү гл 1. изнашиваться, износиться ветшать, обветшать 2. устаревать, устареть; изжить себя 3. черстветь, зачерстветь (о хлебе)
искечә нар по-старому, по старинке, по-старинному
искече сущ 1. старьёвщик 2. консерватор, рутинёр