Наклонную кормовую мачту арабы называли "мизан" - весы, отсюда современная бизань(-мачта). По-англ. mizzen-mast. В то же время бизань якобы от нидерл. bezaan ( http://ru.wikipedia.org/wiki/Бизань ).
В нем. вики подробнее: http://de.wikipedia.org/wiki/Besansegel
Das Wort Besan ist niederländisch vom arabischen Wort mazan für Mast, dessen Segel das Schiff in gleichmäßiger Fahrt hält. Dieser Begriff gelangte wie auch andere Marinebezeichnungen arabischer Herkunft durch den Mittelmeerhandel in das nördliche Europa. Ältere Formen des Begriffes in deutscher Sprache sind missan (1487) und Meisan (1636). Erst ab dem 16. Jahrhundert erschien die heutige Form mit dem anlautenden Buchstaben b. = Гуглперевод: Слово Besan голландское от арабского слова на мачте, которого держит корабль в постоянной скоростью. Этот термин пришел как другие обозначения морских арабского происхождения через Средиземное море торговле в Северной Европе. Старые формы слова в немецком языке missan (1487) и Meisan (1636). До 16 века, появилась современная форма с начальной буквой б звук.

http://www.etymonline.com/index.php?term=mizzen mizzen
early 15c., from M.Fr. misaine "foresail, foremast," altered (by influence of It. mezzana "mizzen") from O.Fr. migenne, from Catalan mitjana, from L. medianus "of the middle" (see median). Klein suggests the French word is from Arabic, via Italian.

почему они решили, что от слова "середина, средний" непонятно, бизань-мачта скорее крайняя мачта, а не средняя:

Бизань-мачта (нидерл. bezaansmast) — название кормовой мачты на трёх- и более мачтовом судне. На трёхмачтовых судах бизань всегда третья, на многомачтовых — последняя, а все мачты между бизань-мачтой и фок-мачтой называются грот-мачтами и различаются порядковым номером. Кормовая мачта на двухмачтовом судне также может называться бизань-мачтой, если носовая значительно её больше и находится в середине судна. http://ru.wikipedia.org/wiki/Мачта

median (adj.)
1590s, from M.Fr. médian (15c.) and directly from L. medianus "of the middle," from medius "in the middle" (see medial (adj.)). Originally anatomical, of veins, arteries, nerves. Median strip "strip between lanes of traffic" is from 1954.
median (n.)
"a median part," 1540s, from L. medianus (see median (adj.)).
medial (adj.)
1560s, "pertaining to a mathematical mean," from L.L. medialis "of the middle," from L. medius "in the middle," from PIE *medhyo- "middle" (cf. Skt. madhyah, Avestan madiya- "middle," Gk. mesos, Goth. midjis, O.E. midd "middle," O.C.S. medzu "between," Arm. mej "middle"); perhaps related to PIE root *me- "between."

не очень ясно, откуда куда произошел переход б-м. Кстати, в самом слове "бизань" нет ли корня "вис, висеть, весы"? Нет ли связи с "безмен" (также весами)?