> Можно. Если определить гаплогруппу, то можно определить и количество мутаций относительно предка. Всё зависит от качества останков. В этом случае ещё важно не оставить сторонние ДНК на останках. Но можно, да.

Возьмем случай идеальной ДНК, т.е. расшифровали всё, что хотели.
По-видимому вопрос с выяснением какая ДНК старше зависит от вопроса: как определить направление мутации? Ведь мутация - случайная процедура?