>Может это был какой-то совсем другой Новгород?

Первое описание подходит для Пскова. В Пскове река протекает через город, а потом впадает в озеро. И из Пскова напрямую можно по реке доплыть до Нарвы. В Пскове же тройная линия белокаменных стен.

Второе описание подходит для Санкт-Петербурга, там настоящие белые ночи.

Третье - похоже на Нижний Новгород, на реке, которая впадает в Сарматское море.