>Всё переврано до безобразия. Для начала найдите 7 холмов, на
>которых начала строиться Москва. Выберите из них наиболее
>выгодное место. И окажется, что это отнюдь не Боровицкий холм,
>а Красный, Таганский, Швивая (Вшивая) горка. И все дороги -
>туда. И оттуда. Москва-река, судоходная от впадения Яузы и
>ниже. И там была ордынская резиденция.

С точки зрения защиты первоначального поселения от набегов врагов самое оптимальное расположение - это место нынешнего Кремля.

С запада и северо-запада город защищает естественная водная преграда - река Неглинная. "Длина реки составляла 7,5 км, ширина долины достигала 1,5 км, а глубина долины — 25 м." (via)

С востока город защищала река Яуза.

С Юга город защищала река Москва и болотистое место известное ныне как Болотная площадь.

А расположение первоначального поселения ниже впадения Яузы в Москву реку не эффективно с точки зрения защиты поселения. С востока нет защиты в виде достаточно крупной реки.