>По поводу этих цифр могу сделать следующее предположение.
>Через Новгород проходил малый рукав реки, возможно старое основное русло.
>В результате проведения работ по превращению этого рукава в основное русло, грунт со дна реки был перемещён
>и поднят на высоту до трёх метров выше современного уровня реки. Что скажете?

1. Малый Волховец не похож на основное русло Волхова по ширине и глубине.

Карта реки Волхов

2. Уровень воды в средние века был выше не только в Волхове но и в Ильмене:
>> озеро Ильмень в XIV в. своим Тулебельским заливом подходило почти вплотную к Старой Руссе.


>Устранаяются подобные казусы установлением истинного положения указанных населённых пунктов, рек, гор, озёр.
>Допустим:
>В.Новгород = Ст.Русса
>р.Волхов = р.Шелонь
>Ладога = оз.Ильмень
>р.Нева = р.Волхов
>С-Петербург= В.Новгород

..первое упоминание Невы в летописях датируется только 1228 годом. Эту же дату косвенно подтверждает топоним Кякисалми, явно указывающий на то, что крепость Корела первоначально стояла не на реке, а на морском проливе. Наконец, если мощный прорыв ладожских вод, приведший к образованию Невы, случился в XIII веке, то именно борьба за новый водный путь объясняет усиление военной активности в регионе (Невская битва, основание Копорья, Выборга, Корелы и Ландскроны).
http://matholimp.livejournal.com/650954.html
Вероятно территория "города на Неве" (Словенка?) была затоплена прорывом ладожских вод. А когда уровень воды спал, то Петр I откопал его от донных отложений.