Уважаемый Александр!
По-видимому, задет ещё один слой, своеобразных интерпретаций исторических событий на страницах книг. В данном случае интерпретации «эпидемий чумы», которые могли отражать и действительный массовый мор, а могли отображать и что-то иное! Не даром же говорят о «неизвестной» чуме! Наверное, это следует взять на заметку и дополнительно проанализировать! Сейчас не могу вспомнить, где читал о «неизвестной» чуме 17-го века, давно было дело, но вот, например, о чуме в Германии:

//////////////////////////////////////////////////////////////////////
Пик активности приходится на первую половину XVII столетия. Наиболее упорно в Центральной Европе эпидемии чумы держались на местности, включающей в себя города Дрезден (1680), Магдебург (1681), Галле (1682), Гальберштад, Брауншвейг, Эрфрут, Нордгаузен и Мюльгаузен (1682–1683) – «Германское чумное пятно». На его территории отдельные вспышки и случаи чумы встречались до 1711 г., после чего она «совершенно исчезла» из Германии.
//////////////////////////////////////////////////////////////////////

Взято здесь:
<http://www.cbio.ru/v5/modules/news/article.php?storyid=882>

А вот у нас:

//////////////////////////////////////////////////////////////////////
До средины XVII столетия о чуме на территории «излома» в исторических источниках не упоминается, возможно, это не от невнимательности летописцев. Например, Петр Петерей писал: «Московиты, находящиеся за Рязанью и в Татарии, вовсе не знают моровой язвы, страдают же от нее лишь близкие к западной границе, а именно: Новгород, Псков, Смоленск и др.» («История о Великом княжестве Московском», 1620); т.е. в этот период активными оставались очаги чумы, расположенные в северной части Европейского континента
//////////////////////////////////////////////////////////////////////

А позднее:

//////////////////////////////////////////////////////////////////////
Летом 1655 г. моровое поветрие появилось в низовьях Волги и в Астрахани. Затем эпидемия вспыхнула в Казани, где в тот год от чумы погибло 48 тыс. человек. В 1657 г. чума свирепствовала и в соседней с Казанской – Вятской области (северная граница «излома») и в самом городе Вятке. Летом 1657 г. чума снова возобновилась в низовьях Волги, в 1692 г. чума повторилась в Астрахани.
//////////////////////////////////////////////////////////////////////

А ещё помнится, особо выделялась роль Петра в изведении чумы в России, мол, его указы, да общее изменение стиля жизни, да европейские манеры и т.д.
В общем, вопрос с чумой мне представляется не таким уж однозначным!
И полностью соглашусь с Вашей оценкой теории ФиН в этом вопросе! Они, правда, притягивали за уши вопрос с манной небесной, чтобы получить красивую сказку, но картина от этого приглядней не становится!