Вслушайтесь еще раз в имена Иоханнан, Иоанн, Иван, Джон, Джованни, Жан, Ян, Ганн, Ханс, Янош - это все производные Иоанна!

Что касается произношения - мне иногда кажется, что время от времени грамотное население земли вымирало (или истреблялось в войнах), а неграмотное начинало все учить заново по книгам...