Я тоже так думаю. Баптистерии, надо полагать - своего рода помывочные пункты. Дескать, помылся - и иди себе в храм божий, которы совсем рядом находится. Да и ладан-то, наверное, ввели для того, чтобы пОтом особенно не воняло.
Традиционная версия появления баптистериев: в 4-5 вв. крестилось много взрослых людей, вот и строили для этих целей специальные сооружения.
Версия крайне наивная: начиная с конца 1980-х у нас крестится гораздо большее количество взрослых людей, однако ни в одном русском городе мне не доводилось видеть баптистерия.