Думаю, что не в честь стороны света. Вовсе нет. ТАК НАЗЫВАЛСЯ РУССКИЙ ГОРОД. Ставший в 1873 г. английским БОСТОНОМ.

Я уже говорил, что корабли назывались в честь города - Москва, Смоленск, Орел, Ярославль, ВОСТОК.

НАЗВАНИЯ КОРАБЛЕЙ - ПРЕЖДЕ ВСЕГО СИМВОЛЫ.

Почему в честь непреобретенного, но уже утраченного города? В пику англам? Думаю причины было 2.
1. Запад показал иудам на Русском троне, что они вовсе "не свои". Видимо с этого момента Романовы поняли, что надо искать поддержки у народа, который они предали.

Возможно это объясняет и смену фамилий в РАН.

Их опасения вполне оправдались войной 1856 г.

2. Корабли строились целенаправленно для этого похода, возможно. что в результате географических открытий были бы основаны новые колонии. Т.е. их названия были глубоко символичны.