>>кстати по какой причине его в основном стали относить к церковным актам?

Представляю один из примеров, по поводу которого составлялся султанский берат:



(стр.300)
Смирнов В.Д. Крымское ханство под верховенством Оттоманской Порты до начала XVIII века. 1887.
http://rapidshare.com/files/159212348/Smirnov_V_D_Krymskoe_hanstvo_pod_verhovenstvom_Ottomanskoj_Porty_1887.pdf

Как хорошо видно,берат не имеет никакого отношения к вопросам веры, или церковным делам, только сугубо светскому назначению в ханы или вельможный сан.