Ям+чуга имеет прямое отношение к следующему слову- где . ЦЕГ(или ЦЕЖД) безусловно имеет отношение к словам "цедить","осаждать"(осадок). Буквально ямчуга=чистая, очищеный щелок. Первый слог "ям" это скорее всего старый Юс, приставка стоящая для удобства(мелодичности) произношения и смысловой нагрузки не несёт.

имелись несколько слов с упомянутым корнем "цег(ж,щ)" и с одинаковой семантикой:
1)ЦѢШТение-"очищение".
2)ЦѢСТити-"чистить";
3)ЦѢСТило-"очистилище;
4)ЦѢГль-"один только" то есть чистый, без примесей.
(скорее всего сюда же относится якобы латинская "ЦИСТерна" которая означала просто "очистная ёмкость, отстойник".

Отрывок из книги Павла Симони 1903г., где упоминается это слово "цег", а также другие интересные занимающимся этимологией людям слова:



(стр.174 и 178)

В частности, сера названа "сумпорь", а официально она ведётся от лат.sulphur, какое первичнее?

фраза ..мой цегем мелким, бистрим..
Бистри это "чистый", а жемчуг иначе назывался "БИСЕР", налицо прозрачная этимология "бисера", он просто "чистый". Отсюда связь между емчугой и жемчугом, оба очищеные.