" Предположим, хранятся документы в относительном порядке, но меняется власть и новый правитель объявляет о реформе календаря, а документы со старыми датами запрещает употреблять. И вся государственная машина преспокойно возьмется за работу, часть документов перепишет, в другой части переправят даты."
Вы несколько путаете местами вещи.
1) "документы со старыми датами запрещает употреблять" - если документ УЖЕ лежит в архиве (скажем, опись урожая, собранного 25 лет назад), то никто его переписывать не будет - изменениям подвергнуться в лучшем случае активно используемые документы. Да и то - что это могут быть за документы? Даже в наш век это только паспорт разве лишь... Да некоторые свидетельства...
2) Приведите хотя бы одно свидетельство подобной реформы, когда бы требовали переписывать док-ты... 1917 год? А старые документы никто не изменял... Юридический документ вообще нельзя переписать - иначе он будет ничтожным. Хозяйственный? Бессмысленно. Какие еще?

"Административный аппарат, почти роботы, ленивые правда, поэтому остаются документы просто тупо переписанные и с неисправленными датами. Еще остаются шансы восстановить все как было." - при любой реформе и переписи остались бы затерянные и прочие документы. Кстати документы имеют свойство "расползаться" - например, вторые экземпляры дговоров и прочего. Имеют свойство теряться. Их тогда вообще не найдешь.

"Какая порча и пожар в Троице-Сергиевой Лавре после правления Петра? Это ведь не захолустный монастырь." - я вот тут приводил пример с пожаром в Самаре - легко все погорело... В моем родном ВУЗЕ СибГУТИ в 1993 году (еще до того, как я там учился) погорел целый корпус с библиотекой (часть ее сгорела) - сгорели десятки тысяч весьма и весьма ценных книг, а еще нафиг сгорел ВЕСЬ архив ВУЗА с 1953 по 1993 годы (количество документов измерялось сотнями тысяч). Это не выдумка а правда. И это в блочном здании с системой пожарной сигнализации... А вы - 18-й век...