Почему вы решили что в словаре, который вы привели речь идёт об этимологии слова, то есть откуда оно произошло, а не о том что называется ульем вообще.
Из написанного в словаре следует что УЛЕЙ, это выдолбленное дерево, в котором держат пчёл.
То есть, держат пчелиный улей. Разве здесь написано слово пустота? Является ли выдолбленное в дереве гнездо дятла УЛЕЕМ? Пустота для пчелиного улья раньше называлась БОРТЬ, а как она называлась для птиц, или тогда, когда там никто не обитает. Понимаете уважаемый статин, для людей, раньше, эти вопросы настолько были очевидны, что их даже не комментировали, но современных горе "специалистов", к которым относитесь и вы, это ставит в полный тупик.

Это вам моё поздравление с Новым годом.