Вот, к примеру, "древнейшее" слово "харя".

Одно из значений слов /hariṇa/ и /harit/ - солнце. Скорее всего, здесь корни слова "харя". Ведя Борьбу с язычеством, стремились, как бы, опорочить смысл древних языческих слов. Вполне, возможно, что это были языческие маски - хари у солнцепоклонников. Прослеживается связь слов "лик" и "блик" в русском языке, /āna/ m. лицо и /aṅśu/ - солнце в санскрите, чин "светлый князь" у Олега и светлый - /śveta/ и /savitar/ - солнце, бог солнца. Вспомните, "лицо, особо почитаемое", то есть обладающее большим чином или святостью.

Вообще, на мой взгляд, русский язык собрался из нескольких РАВНОПРАВНЫХ языков (у всякого слова множество синонимов) которые к сегодняшнему дню взаимопроникли до полного неразличения, однако, продолжают использоваться параллельно.
... поэтому "...часть санскрита нам понятна, часть - нет".

Не смогли полностью убрать древний язык, близкий к санскриту, - удалось убрать только часть и заменить ее новоделами. Например, слова "дупло" и "жерло" могли произойти от слова /dara/ - дыра, отверстие, яма, впадина.В украинском языке есть связующее слово "дупа" - задница. Обратите внимание, наша буква "Р" в других языках читается как "П", а наша строчная "д" - как "г". Так,записывая древнерусские слова латиницей и древнегреческими буквами а затем, читая слово по-кириллице, и могли получить часть слов, навроде, дупа и жупа, из которого, возможно, христиане сделали слово "жопа". Кстати, есть и слово "гепа" с этим же значением.
У каких-то слов просто изменяли смысл или фонетику.Возможно, какие=то слова делали, просто повернув латинскую букву набок или кверх ногами.
Не зря же, например, w похоже на м и на з, записанных соответствующим образом. Вот бы прокрутить словарь древнерусского или церковно-славянского языка на поиск этих новоделов. Впрочем, эта версия, вряд ли, найдет единомышленников. Потому что требует большой работы при том, что может оказаться неверной.