Старая форма этого слова БОРТЬ, по видимому произошла от слова буравить или борта. То есть выбрать в сухом дереве сердцевину, оставив одни борта. Иными словами старая форма этого слова получилась от пчелиного дома. Новая же форма произошла, вероятнее всего от слова ЛЕТАТЬ. В процессе работы с пчёлами люди поняли, что они живут сообществом, которое формируется вокруг пчелы матки, и этот пчелиный рой, часто улетает на другое место, поэтому и УЛЕЙ. Однако в Русском языке остались все формы слов связанные с пчеловодством. Расставлю их в порядке возникновения: РОЙ - БОРТЬ - УЛЕЙ - Пчелиный домик.