|
>Есть у него одно "математическое" заблуждение - >скорость мутаций в >панелях ДНК является константой. Это обнаружил до него некто >Жабинский (Жаботинский ?). И Клёсов придерживается этому >безосновательному утверждению. Математического обоснования >этой аксиомы нет
Ради этого я и написал самое первое сообщение по этой теме и даже сделал простые оценки того, что накопление мутаций очень сильно зависит от численности носителей, т.е. величины популяции. Правда, вылез Тюрин и записал меня в эстонцы (что мол я - полное сельпо, вопрос давно разобран, и я просто ничего не понимаю...).
Одна из последних статей Клёсова за 2015 год называется "DNA Genealogy, Mutation Rates, and Some Historical Evidences Written in Y-Chromosome. I. Basic Principles and the Method", т.е. "ДНК генеалогия, скорость мутаций и некоторые исторические факт, записанные в У-хромосоме. I. Основные принципы и методы". Правда она не опубликована в научном журнале, а лежит здесь: https://www.researchgate.net/publication/238107234 Это, похоже, более поздняя переделка его публикаций за 2008 и 2009 годы.
Представлены 2 ряда гаплотипов. Первые 6 в каждом ряду - идентичны. 4 в каждом ряду - смутировали.
14-16-24-10-11-12 14-16-24-10-11-12 14-16-24-10-11-12 14-16-24-10-11-12 14-16-24-10-11-12 14-16-24-10-11-12 14-16-24-10-11-12 14-16-24-10-11-12 14-16-24-10-11-12 14-16-24-10-11-12 14-16-24-10-11-12 14-16-24-10-11-12
14-17-24-10-11-12 14-16-25-9-11-13 15-16-24-10-11-12 14-16-25-10-12-13 14-15-24-10-11-12 14-17-23-10-10-13 15-17-24-10-11-12 16-16-24-10-11-12
Первый ряд 4 мутированных накопили 5 мутаций, а второй - 12. Скорость мутации в такого рода гаплотипе принимается за 0.0088 на акт отец-сын.
Если даже иметь натянутую тройку по теории вероятности, то для частоты мутации в 0.0088 выборки явно очень маленькие. Хотя можно сказать, что раз в одном случае мы имеем 12 мутаций, то, по-видимому, эти индивиды находятся подальше от своих “общих” предков, чем те, которые имеют 5 мутаций.
Эту ситуацию Клёсов комментирует так, что мол если иметь дело только с мутациями, то очевидное (или кажущееся) число поколений до общего предка считается как 5/10/0.0088 = 57 поколений и 12/10/0.0088 = 136 поколений.
Однако такие “очевидные” для Клёсова вещи больше выглядят как натягивание совы на глобус. Во-первых, совсем неочевидно зачем Клёсов делает так называемое “нормирование” – делит число мутаций в каждом ряду на общее число гаплотипов, т.е. 5/10 и 12/10. По смыслу, Клёсов пытается получить некое “среднее число” мутаций, но только какой в этом глубокий смысл?.. Особенно если выборка такая маленькая… А что, если в выборку попали люди, которые действительно очень далеки от “общего предка”?.. Во-вторых, говоря о “поколениях”, Клёсов имплицитно предполагает каждый раз только одного сына у отца. Т.е. если следовать его логике, то в случае одной мутации число поколений между одним “предковым” и “мутированным” будет 1/0.0088 – это где-то 113 “поколений” или 2825 (113*25) лет. Тут надо понимать, что слово “поколение” – обманчивое. На самом деле правильнее говорить о числе пар “отец-сын”. И если, допустим, у нас имеется 113 “отцов”, у которых рождаются по одному сыну, то мы можем ожидать увидеть среди сыновей одного с мутацией (1/0.0088). В данном случае нам не надо ждать 2825 лет, чтобы получить одну мутацию. Допустим теперь, что наш “отец” – обладатель уникального гаплотипа, и он и его сыновья будут иметь в среднем 1.1 сына, т.е. каждые 10 поколений каждый отец имеет по 2 сына. Тогда рост популяции с данным гаплотипом будет описываться геометрической прогрессией, и мы можем оценить время появления первой мутации, как время того, когда популяция достигнет своего 113-го потомка. Это можно оценить из формулы суммы членов геометрической прогрессии: n=ln(1-(1-q)Sn/b1)/ln(q), где q – это среднее число сыновей на каждого отца, т.е. 1.1, b1 – начальное число “отцов”, т.е. 1, и Sn – это сумма геометрической прогрессии, а в нашем случае 113. При таком медленном способе размножения 113-й потомок появится где-то через 26 поколений или 650 лет. А что будет, если каждый отец будет в среднем иметь по 1.2 сына? Тогда 113-й потомок появится где-то через 17 поколений или 425 лет. А если в среднем иметь по 1.3 сына? Тогда 113-й потомок появится где-то через 14 поколений или 350 лет. Теперь допустим, что у нас 10 носителей одного и того же гаплотипа, они бракоделы, и каждый из них в среднем производит по 1.1 сыну. Тогда 113-й потомок появится где-то через 8 поколений или 200 лет.
Т.е. мы видим, что накопление мутаций очень сильно зависит как от числа исходных носителей каждого уникального гаплотипа, так и от скорости роста числа потомков (сыновей). Без таких знаний расчёт числа поколений до “общего предка” просто не имеет никакого смысла.
|