Название такое претенциозное, да. Тем не менее, вполне отвечающее материалу. А с вашей помощью может превратиться и в настоящую методологию. А может даже и сам праязык соберем по кусочкам...

Вопрос непростой и достаточно спорный, тема обширная, буду выкладывать небольшими кусками.

Часть 1. На чем я основываюсь.

Гипотеза 1. Язык создавался прачеловеком. Это было существо – нечто среднее между обезьяной и человеком в современном понимании этого слова. Именно речь сделала это существо человеком.
Гипотеза 2. Никаких инопланетных, космических, божественных и т.п. влияний на зарождение праязыка не было.
Гипотеза 3. Какие-то слова должны были быть первыми.
Гипотеза 4. Первые в истории человека слова были предельно короткими.
Гипотеза 5. Жизнь первобытного человека строилась на инстинктах и (соответствующем инстинктам) ограниченном поле жизненно необходимых понятий. Cловарный состав праязыка соответствовал этим понятиям и не выходил за их пределы.
Гипотеза 6. Поле жизненно необходимых понятий первобытного человека остается актуальным и для современного человека.
Гипотеза 7. Слова праязыка должны обладать некой общностью, соответственно, неопределенностью, поскольку одним словом надо было определить большой круг предметов и понятий, ещё не имевших в отдельности собственных имён. То есть, первыми должны быть слова типа «дерево» (а не дуб, бук, вяз), «трава» (а не полынь, васильки, крапива) и т.д.
Гипотеза 8. На первом этапе зарождения и развития языка, артикуляционный (речевой) аппарат человека был слабо развит. Поэтому отчетливо произносить (и идентифицировать на слух как речь) он мог существенно меньше звуков, чем имеется в современных языках.
Гипотеза 9. Процесс развития артикуляционного аппарата человека по времени был очень длительным. На заметные сдвиги уходили сотни и тысячи лет.
Гипотеза 10. Самые первые слова языка рождались сначала простым и стихийным сочетанием гласных звуков с одним и только одним согласным. Назовём этот согласный звук первым пракорнем языка.
Гипотеза 11. По мере развития артикуляционного аппарата стали возникать слова путём сочетания первого пракорня с другими согласными и огласовкой. Происходило это преимущественно стихийным образом. Некоторая логика словообразования начала работать только на том этапе, когда слова образовывались не непосредственно от первого пракорня, а от уже существующих слов.
Гипотеза 12. Прочие согласные звуки исполняли на первых порах роль дополняющих. Только по мере развития речи они сами тоже становились пракорнями для новых слов.
Гипотеза 13. Среди дополняющих согласных можно выделить один (по аналогии с первым пракорнем), который был первым и достаточно долгое время единственным. Назовем его первым опорным звуком языка.
Гипотеза 14. Во многих случаях для слов, входящих в поле понятий первобытного человека, то, что в грамматике называется корнем слова, являлось реально существовавшим словом, даже если сейчас оно само по себе не используется и считается лишенным смысла.