...Что это за процесс, который привёл к переходу одной фонемы в восемь разных фонем и аффрикат?*

"фонем и аффрикат*,скорее всего,значительно больше. Сколько точно, я не подсчитывал...

Примечательно то, что теорию происхождения доброго десятка фонем из одного "й" придумали те же самые люди, которые иронизировали над официальной версией совпадения нескольких дифтонгических сочетаний в двух носовых гласных.

...Хотите знать точные ответы? спрашивайте у товарищей
ученых-филологов. Им государство зарплату платит, чтобы они
знали точные ответы на подобные вопросы...

А то я не спрашивал. Увы, ученые ничего не знают про "распад первого пракорня", наверное потому, что вы им про это ничего не сообщили. Зато им прекрасно известны несколько волн палатализаций, сформировавших консонантную систему славянских языков и оставившие в том числе и указанные выше чередования. Например чередование к-ч - это след первой палатализации, к-ц -второй. Ну и кое-какие процессы по мельче, типа tj-ч. Стоит заметить, что в ряде указанных преобразований участвовал и "й", но не как преобразуемый элемент, а как вызывавший преобразования (й -это естественно палатальный согласный, если можно так выразиться).

...Пока что товарищи ученые-филологи говорят:
"Чередования, не обусловленные фонетической позицией
звука, представляющие собой отражение фонетических процессов,
которые действовали в более ранние периоды развития русского
языка. Их называют также морфологическими чередованиями, так
как они сопровождают образование тех или иных грамматических
форм, хотя сами по себе де являются выразителями
грамматических значений, итрадиционными чередованиями, так как
они сохраняются в силу традиции, не будучи обусловленными ни
смысловой необходимостью, ни требованиями современной
фонетической системы языка."...

Определение исторических чередований слабо относится к нашей дискуссии. Если вдруг в русском языке появится слово типа tuk, конечное к не будет чередоваться с ч в случае, например, местного падежа, хотя условия, которые приводили к такому чередованию раньше, там будут.

...На мой непрофессиональный взгляд, процесс каким-то образом
совершенствованием физиологии речевого аппарата человека...

Это замечательное, но совершенно недоказуемое предположение

...Оно ровно там же, где и в словах "друг",
"друзья", "дружина", "druh"
(словацкий язык) и вызвано теми же причинами, которые привели
к появлению в одном случае "Г", в другом
"З", в третьем "Ж", а в четвертом
"Х"...

То есть вы не можете сказать, рискну предположить, что и не задумывались. Поэтому версия о палатализации мне нравится больше, хотя бы потому, что на подобные вопросы там есть ответы. Определена относительная хронология этапов, которые встроены в систему праславянского и шире индоевропейского языкознания. Темные места там есть, как и везде, но на такие базовые вопросы теория дает ответы.

...Есть слова, например -батя, -тетя, гдесоединение звуков -т и
-й не привело к появлению -ч...

А почему вы решили, что вы этих словах к -т присоединяется -й? В чем тогда отличие между словами "семя" и "семья"?